对林肯和玛丽来说，婚姻并不一定意味着幸福。因为婚姻没有改变各自的性格，而只是双方暂时的妥协。只要矛盾存在，冲突随时可能发生。
林肯出身贫寒，自小养成了节俭的习惯;玛丽生在富家，花起钱来自然大手大脚。林肯醉心政治，需要大量的时间从事社交;玛丽过分自我，总试图时时刻刻控制林肯，唯恐他被别的女人抢走。随着林肯公众地位的不断提高，玛丽变得更加疑神疑鬼。这种情况在南北战争期间发展到了令林肯难以忍受的地步。
南北战争爆发后，林肯作为当选总统，率领联邦军队与叛乱的南方军队在前线激战。由于给养困难，许多战士连御寒的毯子都没有，在寒冷的冬天只能露宿野外。而在后方，总统夫人玛丽却挥金如土。她追求上流社会的奢靡之风，想方设法把自己打扮成贵妇们效仿的对象。为此，她派人在国内购买各种昂贵的奢侈品，甚至还跑到巴黎和意大利订购时装和帽子。有一次，一时兴起的玛丽竟一口气买下300双手套，这让过惯了简朴生活的林肯心疼不已。要知道，林肯在1844年竞选国会议员时仅花了75美分!
第一夫人的挥霍无度和奢侈浪费引起了公愤，给林肯带来的不仅仅是经济上的麻烦。由于联邦军失利，有人在国内报刊上放风，说出生于南方且不少家人在南方任职的总统夫人可能是出卖联邦政府的间谍。参议院为此专门举行了听证会。林肯不得不以总统名义向参议院作保，以化解人们对玛丽的猜疑。
有关“玛丽是间谍”的猜疑最终平息了，可玛丽对林肯在感情上的猜疑如影随形，使他倍感苦恼。她把与林肯有过接触的，甚至是林肯偶尔提到的女人列成一份黑名单，加以跟踪防范。她不允许任何女性未经她的同意与林肯交往。
有一次，玛丽和一大群高级军官的夫人在巴多将军的陪同下到前方慰问。旅途中，巴多将军无意间说起，前线军官的太太们都要回后方去，只有查尔斯·格里芬将军的夫人留在前线，因为她得到了总统先生的特许。玛丽一听，顿时变了脸色，大声追问巴多将军：“这么说她单独见过总统?你知道我从来不允许总统单独会见任何女人!”
巴多将军意识到捅了篓子，赶紧为总统掩饰。这样一来，玛丽更加火冒三丈，一连几天对着巴多将军和众夫人大发雷霆，弄得大家都很不愉快。不过对林肯来说，类似的情况早已是家常便饭了。最令林肯下不了台的一次是，他正在议会发表演说，玛丽突然气呼呼地闯进来，冲到他面前，当着众多议员的面抬手给了他两个耳光，惊得议员们目瞪口呆。结果只是因为玛丽听说林肯背着她与别的女人幽会。
可以说，自从结婚后，玛丽对林肯的猜疑从未停止过，一直延续到1865年林肯被刺的那晚。
林肯去世后，林肯律师事务所的威廉对外宣称：“林肯从未爱过他的妻子，他只是形式上娶了玛丽。”当有人问到为什么林肯没有离开他的妻子时，这位先生的解释是：“他的权力观、法律观和荣誉观禁止他背叛婚姻的誓约。”
玛丽并没有对威廉的话作过半点评论，也许她觉得没有必要。想来，她是爱林肯的，只是以她自己的方式。如若不爱，何以生妒?林肯死后，玛丽有一段时间精神错乱。1882年7月16日，她也死了，死的时候手上戴着林肯送给她的结婚戒指，上面刻着这样一句话：“爱是永恒的。”
